Die östliche Lage bringt der Müritz kontinentaleres Klima. Das bedeutet, dass in der Regel die Sommer wärmer und die Winter kälter sind als im westlichen Deutschland.
Durch die Größe der Müritz und abhängig von der Wassertemperatur entsteht beim Wetter in unmittelbarer Umgebung oft ein eigenes Microklima.
Die gewaltige Wassermenge und die unterschiedlichen Temperaturen haben auch Einfluss auf die Bildung und Zugbahn von Gewittern. Schnell kann das Wetter umschlagen und es können sich lokale Gewitterzellen entwickeln, die gerade für Wassersportler gefährlich sind.